土壤搜索挖掘新类的抗生素

一个新类的抗生素——名叫malacidins已经从众包由研究人员发现基因筛选微生物土壤样本。

这一发现来自一个公民科学项目药物从泥土——开始肖恩·布雷迪洛克菲勒大学的我们。项目要求人们把土壤中,使微生物的DNA可以提取并测序。

布雷迪的团队正在寻找为calcium-dependent抗生素基因代码,一个小型家庭需要钙的环肽为他们的活动。他们用PCR引物,搭上常见的生物合成的基因识别变异的基因内的土壤。这导致他们发现整个基因簇与感兴趣的基因,编码一个新的calcium-dependent抗生素肽的家庭。

”(抗生素)只获得3 d形状的钙,这使他们然后绑定他们的目标。我们喜欢这个功能,因为这意味着抗生素并不是“在”,”布莱迪说。“这可能是一种减少阻力。

虽然calcium-dependent, malacidins的结构和作用方式不同于其他抗生素在这个家庭。(Malacidin)结合后期细胞壁中间关闭细胞壁生物合成,一样万古霉素-著名的最后的抗生素,”布雷迪说。

当他们植入的基因簇链霉菌属细菌细胞产生两个新的抗生素,对革兰氏阳性细菌被发现是活跃,包括耐多药的病原体。一个(malacidin)成功消毒伤口感染MRSA在老鼠模型中。哺乳动物细胞没有毒性。

我们认为不同模式的行动是非常激动人心的。它表明,甚至有更多的人,”布莱迪说。土壤中有百分之十的DNA序列,看起来是与此相关的组。也许我们不是用抗生素在这样的绝境。有证据显示大量未开发的抗生素在环境,”布雷迪补充道。

Malacidin的作用方式也意味着阻力不大可能发展,因为它是通过捆绑供给细菌细胞壁的构建块,而不是针对一个可能变异的关键酶。

鲍勃·汉考克,加拿大英属哥伦比亚大学的微生物学家,说团队用于生产抗生素的方法是“真的blue-printable”,可以用来制造很多新的抗菌化合物。”,会给我们新的化学领域中去发现抗生素,”他说。