映射与人工智能药物发现的路线

Covid-19流行病席卷世界,PostEra目标是把世界上集体智慧的化学家与公司的人工智能(AI)算法解决新型冠状病毒

“我们意识到有数百名化学家坐在家里,与他们的项目,”首席科学官αLee说。所以PostEra建立了一个非盈利的月球探测器项目利用这些资源。

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创始人亚伦莫里斯,马特·罗宾逊和α李(唐森)正在进行他们的Covid-19项目锁定在圣克拉拉,我们

工作建立在快速和协作对Covid-19全球努力寻找新的药物。今年1月,中国科学家的决定晶体结构病毒的主要蛋白酶酶病毒复制的关键,没有已知的在人类细胞,使其成为良好的药物目标。在2月和3月,研究人员在钻石同步加速器设施在英国开始筛查分子片段结合这个蛋白酶。的3月26日,他们发现了66年。

然后PostEra介入,要求国际社会的药物化学家设计可能的候选药物通过缝合这些碎片成理论的化合物。的4月7日400年贡献者已经提交了3500多件的建议。提交进来,公司利用其算法来解决这些化合物的最容易,最可能的工作,至少可能有毒。这产生一个初始的250种化合物,随着合成配方。PostEra合同制造商发送这些信息烯胺在基辅,乌克兰,创建它们。100年4月8日,第一个抵达牛津大学,英国,那里的研究人员将测试如何绑定到蛋白酶在实验室里。

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团队呼吁世界药用化学家提出基于分子片段结合的主要病毒蛋白酶,然后使用PostEra缩小了选择的AI和最有前途的领导由烯胺在乌克兰进行测试在牛津大学,英国

项目采用PostEra合成实验室工具,设计合成路线。这个工具的分子变压器算法已被训练理解化学使用图书馆的900万反应发表在美国专利。该算法使用微笑符号转换结构化合物的信息,以及一些3 d立体化学信息,到一个文本字符串,然后可以送入基于语言翻译算法

2019年8月研究小组报道,该算法优于一组11人从麻省理工学院的化学家,我们,和其他计算机模型,预测80年随机反应的结果。最好的人组是76.5%准确的,而模型是87.5%准确的。重要的是,该算法还估计自己的不确定性预测的准确率为89%。李说,这些措施的不确定性,有助于找出实验将创造最丰富的数据塞回模型来改善其结果。

自那时以来,团队提高了算法的效率和适应它专注于相反的场景:“鉴于你想做什么,你如何做?”李说。大多数药物发现人工智能方法集中精力回答问题的化合物,但如何使这些化合物小姐,”李还在继续。我们提供我们的客户不仅仅是化合物的解决方案,但如何让它们的合成路线。

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路线

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以及确定承诺铅化合物,AI算法可以提出合成路线

李和亚伦首席执行官莫里斯在牛津大学学习时第一次见到数学在2010年代初;他们辩论俱乐部的合作伙伴。“我们是唯一两个科学孩子想做公共演讲,”莫里斯笑了。我们告诉自己,我们是好的。“李搬到剑桥大学的开始研究小组作为一个学生,马特·罗宾逊加入。到那时,莫里斯高盛(Goldman Sachs)是一个投资银行家。一起三个决定商业化所做的工作在李的实验室在2019年晚些时候,罗宾逊和共同创立10月PostEra,首席技术官。

考虑到公司才成立几个月大流行之前,他们没有时间在很多项目上工作。他们与美国化学协会做了一个项目,帮助基准生物活性的各种模型的预测。工作是在2020年完成,并通过审查出版,现在莫里斯说。实用的,他补充说,小型生物技术公司努力合成所需的化合物。

非营利Covid-19集中项目,团队说,“很意外”成功。我们预计大约50 - 100份提交,李说。“这真的是一个过山车。”

整理第一批2000提交了AI 48小时左右;团队估计会被人类大约3周做同样的工作。下一批提交绑定通过加强重点片段,共价键蛋白酶。共价连接,李说,“永久黏性物质。但另一方面是很被动的,“这可能引发不必要的副作用。

”现在,我们得到了实验数据,”李说,他指的是100种化合物由烯胺和送到牛津。一旦我们得到,我们可以决定哪些会变本加厉。时间就是生命,”他说。我们的目标是达到临床前阶段在6 - 8个月。

PostEra其他几个项目,尽管许多被搁置在大流行期间,莫里斯说。他指出,其中一个是关于发展与物质滥用的药物旨在帮助。我们也积极寻求将成员添加到团队,”李说。

PostEra

成立日期:2019年10月

最初地点:英国伦敦;现在圣克拉拉,我们

员工人数:3(所有合伙人)

简而言之:起源来自英国剑桥大学的消磨

资金日期:250万美元(£200万)从我们种子加速器Y Combinator,风险资本基金,天使投资者包括数据在Facebook的前负责人