垃圾DNA都是垃圾吗?

很难找到最近的一项科学研究,有兴奋更多争议的国际合作编码(百科全书的DNA元素)。这个项目,由美国国立人类基因组研究所花了九年的人类基因组分析找出有多少我们的DNA有“目的”——多少积极贡献我们的生存能力。结果,¹终于在一个特殊的问题自然2012年,引发了耸人听闻的标题不同意这样的观点,我们的基因组是由“垃圾”积累通过进化的凌乱的修修补补。相反,编码团队建议80%的DNA功能——执行重要生化角色。发现,根据科学,写了一个“垃圾DNA的悼词”。

而大众媒体宣布了一项革命我们对基因组学的理解,一些进化生物学家,遗传学家和生物化学家喊犯规。他们不只是表明结果是开放的解释;他们谴责他们是炒作,指控研究者的基本文明科学辩论无知和紧张的边界。甚至连relativity-defying比光还快的中微子的²2011人接受更多的宽容。

垃圾揭穿

当然有声音和合理理由编码的说法表示异议。关键是没有普遍生物学“函数”意味着什么——本身反映了进化生物学的不稳定的舞蹈必须执行的概念的目的。编码的批评者认为,如果删除一段DNA和发现一个特定的表型消失,那不是相当于发现DNA的功能。福特杜利特尔加拿大达尔豪斯大学的权威“垃圾DNA”,把它非常清楚:“心脏病学家并不是说它是心脏的功能做一个巨大的噪音,虽然停止的心会安静的。”³在进化生物学的功能特性,杜利特尔声称,是最好的表达为被选中的原因,没有效果。功能,比如据说一切生物,只有在演化的背景下才有意义。

现在,编码没有事实上甚至接近识别任何类型的函数,前垃圾DNA。它显示,大约80%的基因组转录成RNA。我们已经知道大约99%的DNA不编码蛋白质,这已经很清楚了,由于解码基因组的2001年,大多数可遗传的人类的特征,包括疾病的易感性,在编码区域之外。人们普遍认为基因组的非编码区域施加监管影响其他基因通过RNA转录。但它真的可以,大多数的基因组包含这样的领域,很少是真正的垃圾?有什么真正的证据表明这些RNA是真正在做什么,而不是单纯的声音?

杜利特尔解释了困境:我们知道,一些生物有更多比我们DNA——肺鱼30倍。如果肺鱼真的需要额外的DNA,那么它一定是比人类更加复杂。这是可能的吗?还是我们只是幸运特别junk-free ?

废话

的几位编码财团已经写回应他们的批评者,而不是固执地坚持着他们的立场,是和平的努力理清混乱。⁴他们承认有争议的DNA功能的定义:进化生物学家,函数意味着选择性约束;遗传学家,表型的后果;生物化学家、转录和分子活动识别候选功能角色。不同的定义包含不同数量的基因组,和重叠的程度还不清楚。但是团队承认,一些低级的转录可能是随机的,没有任何功能。评论编码的值作为一个公共资源是更重要的比任何临时的估计分数的人类基因组功能的可能解释一些策略是一种妥协,初步估计80%的功能。但是很难反驳认为编码提出了一些值得仔细研究的深刻的谜题,而不是骂人。

杜利特尔说的编码喧噪生物学中许多最激烈争论的不是事实,而是这句话用来描述我们认为事实可能的。也许直言不讳的构架方式,情绪:教条往往是成反比的理解。对于超光速中微子,问题只是实验结果是否可信。但是如果你甚至不能同意使用的词和概念框架解释,有一个更基本的问题。当然,这并不是说,生物学是建立在沙子,但它确实表明,使编码需要努力思考的感觉,不是大声咆哮。