预印本服务器上有1581篇关于Covid-19的文章medRxiv而且bioRxiv.考虑到新型冠状病毒Sars-CoV-2在1月初首次被描述,2月11日才正式命名,这代表着大量出版物的出现。

同行评议的论文现在以极快的速度发表。“重要的是要尽快提供科学信息,但在大流行期间也要尽快评估科学信息,”解释说马格达莱纳河队长,主编大自然。

我想他可能两三天没睡了。他狂热地以极快的速度克隆

Daniel Wrapp,德克萨斯大学奥斯汀分校

自然要求作者在提交论文时立即将其论文存入预印本服务器,并将底层数据存入认可的存储库。“直接分享数据对人们的生活至关重要。我们从以前的流行病中了解到这一点,”斯基珀说自然在2018年。自然还向世界卫生组织发送新数据,世界卫生组织正在汇总有关Covid-19的信息。

他说:“研究的速度和研究成果的呈现令人吃惊。汤姆·加拉格尔他是芝加哥洛约拉大学的冠状病毒科学家。他说,论文的质量可能是不稳定的,但“有些论文是最好的,它们能这么快就出来,真的很了不起。”“在正常情况下,一些病毒学论文可能需要数年时间才能完成。加拉格尔说:“在一个月内完成这些作品,我觉得真的很神奇。”

结构完整性

一些结构生物学论文自然科学,而且细胞,他补充说,一直是尤其是暴露。对他来说,最突出的是最近的自然论文显示病毒结合域与人类受体相互作用时的晶体结构。加拉格尔说:“细节程度惊人。”它的出版是在一个特别加快的过程中快进的。其他的报纸也没有给他留下深刻的印象。

SARS-CoV-2嵌合RBD与人ACE2复合物的图像

来源:©2020施普林格自然

两篇论文自然最近确定了Sars-CoV-2受体结合域与人ACE2受体复合物的晶体结构

病毒学家杰里米-罗兹曼英国肯特大学的教授认为大多数论文,包括预印本,都提供了非常好的数据,尽管有些论文没有达到标准,可能最终不会发表。在他看来,我们已经越过了一个顶点。罗斯曼说:“几周前,大多数研究都非常新颖,对我们对病毒和公共卫生政策的理解产生了很大的影响。”“现在,很多研究都必须根据重要性和影响进行分类。他发现,从论文中挑选出最好的论文要花费更多时间。

2月份发表的一篇早期的重要论文描绘了这种结构Sars-CoV-2的刺突蛋白使用低温电子显微镜在研究人员和该杂志的大力推动下科学快速跟进。这种峰值与冠状病毒感染细胞有关,是药物和疫苗的潜在靶点。中国研究人员在1月初公布了基因组,杰森·麦克莱伦的实验室德克萨斯大学奥斯汀分校的科学家们没有浪费时间对基因片段进行排序。王念双博士后将刺突蛋白的片段拼接在一起,并在几天内转染了半升哺乳动物细胞。

三维结构6VSB

来源:PDB ID: 6VSB D Wrapp et al,科学, 2020, DOI: 10.1126/science。abb2507 RCSB PDB

Sars-CoV-2的刺突蛋白是论文中揭示的许多重要发现之一,这些论文已被快速跟踪,为研究人员提供了有助于缩短大流行持续时间的信息

“我想他可能两三天没睡了。他狂热地以极快的速度进行克隆,”这篇论文的第一作者、博士生五年级生丹尼尔·瓦普(Daniel Wrapp)说。然后,Wrapp纯化了蛋白质,并开始收集冷冻电子显微镜数据。他回忆说:“有几天,我只睡一两个小时。”这份预印本一上线,就有数十名研究人员向德克萨斯实验室发送电子邮件。几周内,切赫Kral他在芝加哥伊利诺伊大学的研究小组上传了他们的预印本在短肽抑制剂上该团队设计了一种与Sars-CoV-2受体结合域结合的病毒科学纸。Kral希望这项工作能帮助药物化学家开发对抗冠状病毒的新药。他说,现在每个人都在赶时间。“我们用了大约两周的时间完成了论文,并把它放到了网上。这篇论文已提交给一家化学杂志进行同行评审。

保证质量

罗斯曼说,一些期刊“正在使用他们的标准方法”发表科学论文。“网上发布的许多关于Covid-19的论文已经无关紧要了。他说,疫情的爆发以及我们对它的了解都有了进一步的进展。他赞扬了那些为关于Sars-CoV-2的论文制定了特殊快速通道的期刊。罗斯曼补充说:“加快流程的唯一需要注意的是,我们并没有降低同行评议的质量”,因为获得及时的信息不仅重要,而且信息的可信度也很重要。

不幸的是,有时第一次和错误比第二次和正确更好

科克大学的Darren Dahly

一个它似乎掉在了围栏上据报道有24个病人接受了羟氯喹和阿奇霉素。它最初以预印本的形式在medRxiv该论文于3月16日发表,并于3月20日在一份期刊上发表。这种迅速的转变引起了人们的质疑。国际抗菌治疗学会(ISAC)发表了这项研究远离工作

“对照组不是随机的,”他说达伦哒他是爱尔兰科克大学的生物统计学家,第一次读这篇论文时并没有被打动。一些患者退出了治疗组,其中大多数患者预后不佳。他补充说,应对大流行的紧迫性是合理的,但也存在一种争先的学术文化。“不幸的是,有时第一次和错误比第二次和正确更好。“另一个刚出的纸新英格兰医学杂志瑞德西韦也没有对照组,达利警告说,这并不能告诉我们药物的疗效。

挑战极限

平均自然Skipper说,这篇论文通常需要两到三周的时间来审查,但该杂志现在要求评估Covid-19手稿的审稿人在短短几天内对它们进行审查。她补充说,“通过对需要修改的内容做出明智的编辑决定”,针对Covid-19的审查过程也在加快“他们中的大多数人都没有经过我们通常的辅助编辑和制作过程,这是非常先进的在线出版。”自然该公司还表示,在可能出现大量修改的情况下,他们会及时与作者沟通,以便他们决定是否将他们的论文转移到其他地方。“我们不想放慢它的出版速度,”斯基珀解释道。

继续做我们的研究是令人兴奋的,特别是当它对正在进行的大流行有潜在的直接转化影响时

Daniel Wrapp,德克萨斯大学奥斯汀分校

对审稿人也提出了额外的要求。加拉格尔的论文越来越多,编辑有时会要求在三天内进行评审。Wrapp说科学让潜在的评审员排队,整个过程花了不到一周的时间。罗斯曼补充说,许多具有相关专业知识的研究人员被关在实验室之外,他们非常愿意通过同行评议来做出贡献。我已经审阅了两篇论文自然最近,免疫学家说路加福音奥尼尔他在爱尔兰都柏林三一学院的实验室已经关闭。他说,同行评审的速度确实加快了,但仍然很严格。我不会有任何问题的。他补充说,从历史上看,如果一篇论文非常新颖,审稿人很乐意放过作者,而Covid-19的论文可能就像它们一样新颖。奥尼尔说:“如果论文不够新颖,推荐人的要求就会更高,但多年来论文都是这样。”

对于大型期刊来说,对Covid-19论文的同行评审仍然是神圣不可侵犯的。斯基珀说:“无论在什么情况下,都不能在同行评审的质量或审查上妥协。”她继续说道:“同行评议者是经过严格挑选的,我们会根据需要邀请尽可能多的评议者。”尽管一些自然编辑人员由于时间紧迫,杂志还没有招聘新员工。斯基珀说,这是一个最大限度发挥与大流行相关专业知识人员潜力的问题。斯基珀说:“我们的病毒学编辑每周收到的稿件是平时的两到三倍。”与此同时,其他工作人员也在提供尽可能多的内部支持。她发誓,优先考虑新冠肺炎论文不会损害其他学科。“我们从未阻止其他任何论文发表。我们认为这对其他研究人员或作者不公平。我们试图在内部满足这一领域的额外需求。

当对Sars-CoV-2的研究刚刚开始时,Wrapp回忆起实验室是多么充满活力。他说:“我们知道(刺突蛋白结构)有可能成为试图开发疗法和疫苗的研究人员真正有价值的信息。”Wrapp工作的麦克莱伦实验室是少数几个仍在运行的实验室之一,与其他大约40个实验室在同一栋楼里。Wrapp说:“继续做我们的研究是令人兴奋的,特别是当它对正在进行的大流行有潜在的直接转化影响时。”他说,这是一种我们通常感受不到的紧迫感和责任感。