解决这一问题的努力意味着新的想法和技术正在被应用

没有一个星期没有科学的可重复性——或者缺乏可重复性——登上头条。尽管很多批评都是针对生物医学或心理学的,但同样的问题也普遍存在于化学科学中。

一个调查了1500多名科学家自然去年的报告显示,70%的研究人员认为科学面临着可重复性危机。然而,超过一半的人仍然对他们所在领域发表的文献有信心——化学家是最有信心的人之一,尽管他们报告说复制其他研究人员或他们自己的工作是最困难的。尽管这一观察结果似乎相互矛盾,但一种解释可能是化学家们更经常地希望精确地重复实验,他说里克Danheiser他是麻省理工学院的有机合成化学家。

化学杂志上的文章因人们无法准确地命名化合物而受到影响

安妮塔·班德罗斯基,加州大学圣地亚哥分校

Danheiser是这份非传统期刊的主编有机合成这证实了自1921年成立以来发表的所有论文的实验。该杂志的做法是,在发表研究结果之前,先让独立的化学家对其进行复制——这种做法在化学或任何其他研究领域几乎闻所未闻历史上很少有这样的例子).所有实验都在杂志编辑委员会的实验室进行重复性检查,通常由研究生和博士后研究人员在该委员会的监督下工作有机合成编辑器。Danheiser,他做过关于可重复性,他告诉manbetx手机客户端3.0该杂志通常会在六个月内对提交的论文进行检查。

但Danheiser说,将这种复制过程推广到其他领域具有挑战性,因为生物学通常有太多的变量,而物理学和一些化学领域需要使用专业或昂贵的设备,而这些设备在其他实验室中可能不容易获得。Danheiser指出,在2010年至2016年期间,该杂志因产量不可重复性或选择性而拒绝了7.5%的投稿。“大多数化学家会认为这很可怕,”他补充道,因为传统期刊上的论文因此不太可能被重复。

“甜蜜点”

他指出,在再现实验时,化学在某种程度上处于“最佳位置”,因为所使用的仪器通常不是太奇特德里克·劳他是一名药物化学家即将发布的博客.但他指出,例如,在自然产物化学中,用于生产化合物的多步骤合成几乎没有一种是获得产品的可行方法。因此,大多数细菌一开始就无法完全复制,洛解释说。事实上,他说,在大多数情况下,产品通常很容易从原始来源获得。洛说,人们所建立的基础是研究人员在制造化合物时使用的独特技术。

Lowe补充说,药物化学和药物发现文献是化学中更可复制的领域,因为它们更广泛地由行业科学家进行,他们很少有动机发表虚假或不合格的结果。Lowe指出,行业研究人员对专利文献的贡献更多,缺乏可重复性和严谨性的专利可能会导致法律问题。

化学的再现性问题应该是一个“相当容易解决的问题”

菲尔·巴兰,斯克里普斯研究所

此外,Lowe认为,在发表前沿研究的高端期刊和低端期刊中,不可重复性是一个更大的问题。大多数可靠的论文都可能发表在Lowe所说的中等期刊上——那些受人尊敬但不引人注目的期刊。

跨学科界限

这个月,化学探针门户加入了275种化合物。该门户网站是使科学更具可重复性的运动的一部分,并拥有用于药物发现和研究生物过程的许多小分子的数据库。门户网站正在解决的问题是双重的,他说艾米·唐纳他是该公司驻波士顿的负责人。她说,较小的问题是确保实验中使用了合适的试剂。然而,导致“我们在文献中看到的大量不可重复性”的更大问题是误解了如何使用这些高效的化学探针来调整生物体中的生物过程。

化学探针门户网站截图

来源:www.chemicalprobes.org

化学探针门户是化学家处理再现性问题的工具之一

唐纳说,化学探针的数量有数万个,这本身就是一个问题。生物学家——他们最有可能在实验中使用探针——并不一定具有进行相关化学验证测试的专业知识,以确定哪些分子在他们的实验中最有效,Donner说。这就是化学探针传送门发挥作用的地方提供关于哪些探测适合于特定情况以及最好避免哪些探测的建议.唐纳解释说,研究人员可以搜索他们的目标蛋白质,并找到与之相互作用的分子列表。

Donner说,目前还没有列出化合物信息的检查表,相反,科学家们依赖于收集探针的信息。在门户网站上分享这些信息可以避免其他人重复这项工作,并告诉调查人员他们应该如何设计实验,同时考虑到探测器的优点和缺点。

但该门户仍处于起步阶段,研究人员面临着记录数万个分子的艰巨任务,唐纳说。目前,优先级是突出最好和最差的探测。她补充说:“从短期来看,这是我们能够产生最大影响的方式。”

标准化命名法

研究资源标识符(RRID)是另一个旨在通过帮助标准化文献中如何引用试剂、软件、抗体和模式生物来提高研究可重复性的倡议。尽管超过200家期刊已经开始鼓励作者使用rrid引用实验室资源,但化学期刊总体上还没有这样做,他说安妮塔Bandrowski他是加州大学圣地亚哥分校的神经科学家,目前正在协调RRID项目。

根据Bandrowski的说法,“化学杂志上的文章也受到了人们无法准确命名化合物的影响。”Bandrowski说,由于很难教会每个人使用恰当的命名法,人们的注意力主要集中在促使研究人员至少使用数字标识符,比如PubChem ID.她说:“我们的研究结果表明,作者在提供这类信息时准确率很高。”

另一个席卷工业化学的现象是电子实验室笔记本(eln),它存储实验数据和程序,允许研究人员在收集数据多年后访问数据。eln的一个特点是,它们允许研究人员搜索反应物和产物的分子结构,使其更容易跟踪反应。在研究小组或公司内部,可能会建立eln,让科学家可以搜索同事的笔记本,这对于避免重复工作和评估重复实验的差异很有用。但eln在学术界的应用速度较慢,可能是由于其高昂的成本。

电子实验室笔记本电脑

来源:Blend Images / Alamy Stock Photo

电子实验室笔记本提供了一系列功能,可以确保数据永远不会被乱放——不像长期以来一直是实澳门万博公司验室必备的纸质笔记本

他说,有很多eln都有不同的收集和存储数据的方式理查德•惠特比他是英国南安普顿大学的有机化学家Dial-a-molecule网络,旨在加快合成新分子的过程。该网络的另一个目标是促进ELN数据的标准,以实现交换和数据挖掘。惠特比补充说:“专为化学设计的eln会为你的使用带来回报。”他指出,它们也有一些有用的功能,如化学计量计算和实验安全数据,这在一定程度上弥补了澳门万博公司使用ELN比使用纸质笔记本更难的事实。

菲尔Baran加州拉霍亚斯克里普斯研究所的合成有机化学家,他说在博客上开瓶帮助他的团队解决实验的可重复性和透明度等问题。巴兰指出:“这种方法比传统的同行评议更有用。”他说,与其他领域相比,化学的再现性问题应该是“相当容易解决的问题”。他说,解决办法是让作者有责任明确他们的支持信息,并鼓励他们与其他实验室合作,对他们的工作进行检查或实地测试。Baran说,期刊也应该制定针对不同学科的规则,不应该再允许只有文本支持的信息,尤其是那些主要结果是让其他人复制一份协议的方法学论文。