使用先进的电脑开卷胶原蛋白

英国和法国的研究人员利用现代计算能力提高质谱和分析一个极其复杂的胶原蛋白分子在很短的时间内。

二维傅里叶变换离子回旋共振质谱(2 d FT-ICR MS),在1980年代开发的,链接前体的质荷比和碎片在复杂样品。与串联质谱相比,2 d FT-ICR女士不需要隔离的前兆,显示了更好的分辨率。它的应用程序是有限的,然而,由于缺乏先进的电脑。

胶原蛋白,一种结构蛋白的摩尔质量超过400 kda,是一个非常稳定的分子,持续数千年的老骨头。彼得·奥康纳华威大学,他的团队和合作者在法国旨在利用蛋白质组学研究考古胶原蛋白样品,在这个过程中,先进的2 d FT-ICR女士到新的高度编码调制频率的前体离子和传播的信号。改进技术的一大优势是时间尺度——串联质谱的胶原蛋白至少需要14个小时,而2 d FT-ICR女士只需要一个小时在本研究使用数据处理项目。

对这项工作的真正令人兴奋的是,它表明,我们可以有效地使用质谱序列肽在一个非常复杂的混合物,”O ' connor说。海莉西蒙,他驾驶项目,描述了研究的意义:“如果你有东西质量和片段,你可以做2 d的女士。有这么多的潜力,只是等待探索。”

约瑟夫厕所高性能质谱和蛋白质组学专家在加州大学的洛杉矶,我们描述了研究的第一个真正的示范潜在价值的2 d FT-ICR女士对于分析复杂混合物。的技术将改变未来将如何执行实验对于复杂的混合物。谁不会想要更多的信息更快吗?”