四年的化学预印本

2017年夏天，化学出版领域悄然发生了革命性变化——两台预印本服务器的推出。预印本是尚未通过同行评审程序或在传统期刊上发表的科学论文的早期版本，预印本服务器是免费的在线存档(或存储库)。

预打印服务器并不是一个新概念。第一,arXiv，成立于1991年，为理论物理学家。三年后，SSRN在社会科学领域启动。在过去的几十年里，这两种预印本服务器都大大扩展了它们的范围，并且推出了许多其他服务器。其中一些在他们的范围内有化学，甚至有一个化学预印本服务器在21世纪初的一段时间。

然后，在2017年8月，发生了两件事。首先，SSRN预印本服务器(最初用于社会科学，目前由出版巨头爱思唯尔运营)推出了一个名为化学研究网络(ChemRN)的分支。然后，大约一周后，ChemRxiv由美国化学学会(ACS)发起，现在由ACS、英国皇家化学学会以及中国、日本和德国的化学学会合作运营。万博代理

每个人都意识到预印本就像一辆行驶的火车，你必须上车，否则就会被落下

唐娜·布莱克蒙德，斯克里普斯研究所

这两个人最初都不受化学界的欢迎。美国加州斯克里普斯研究所的化学教授Donna Blackmond解释说，最大的问题是，坚持认为，寄存研究成果会使其失去必要的新颖性，从而无法在他们的期刊上发表，尤其是一些期刊编辑ChemRxiv科学顾问委员会。

一开始，一些化学期刊接受了预印本的投稿，一些不接受，还有许多期刊根本没有预印本政策，让作者猜测。布莱克蒙德说，所有化学杂志花了大约一年时间才接受预印本。美国癌症学会的旗舰期刊美国化学学会杂志，坚持的时间最长。她补充说:“每个人都意识到预印本就像一辆行驶的火车，你必须上车，否则就会被落下。”

一旦期刊编辑给他们开了绿灯，化学家们对使用预印本服务器的信心飙升。François-Xavier Coudert说:“化学期刊接受已经作为预印本发布的手稿提交引起了很大的(思维方式)变化。”Coudert是巴黎法国国家科学研究中心的计算化学家，也是法国化学学会的成员ChemRxiv科学顾问委员会。

在推出四年后，预印本服务器现在已经在化学界站稳了脚跟。2020年，发布预印本5137篇ChemRxivChemRN上的3538。同年，ChemRxiv预印本共被访问16,120,921次，ChemRN预印本下载499,553次。

快速的传播

在大流行期间，预印本在迅速和公开传播研究成果方面发挥了至关重要的作用。甚至在欧洲发现Covid-19之前，总部位于伦敦的威康基金会就已经协调了一项公开声明呼吁“迅速、公开地分享与Covid-19疫情有关的所有研究结果和数据，为公共卫生应对提供信息，帮助拯救生命”。该声明由数十个资助者、学会、出版商和机构签署，预印本服务器被列为促进这一进程的一种方式。

与生物学和医学相比，化学预印本服务器的大流行病提交量增加较少，但与冠状病毒相关的内容仍占据了前十名中的八名ChemRxiv的所有时间访问最多的内容列表。

当我看新闻，看到有人谈论Covid预印本时，我经常在想“得了吧，你知道这可能是胡扯”

霍西·尼尔森，加州理工学院

2021年5月访问次数最多的预印本(4月访问次数第二多的预印本)是Vittorio Saggiomo的协议获奖理由是将一个铝制咖啡荚变成了一个微型化学反应器，可以在不到30分钟的时间内通过颜色变化来报告Sars-CoV-2的存在。Saggiomo是荷兰瓦赫宁根大学生物纳米技术小组的助理教授，他还不知道“CoronaEspresso”方案是否已经达到了预期的目的。不管怎样，这是一个ChemRxiv打击。截至2021年7月底，预印本已被访问近2.1万次。根据Altmetric的数据，这份预印本还在19家新闻媒体和4个博客上得到了突出报道，被推了约1044次。

自大流行开始以来，与冠状病毒相关的数百个(如果不是数千个)预印本只是新闻中的一个。这并非没有问题。与同行评议的内容相比，并不是每个新闻主持人或记者都对预印本抱有额外的疑虑。美国加州理工学院有机化学教授霍西·纳尔逊说:“当我看新闻，看到有人谈论Covid预印本时，我经常在想‘得了吧，你知道这可能是胡扯’。”

同行评议当然不是完美的，但它往往是一种有效的把关过程，将科学文献中的废话拒之门外。大多数预印本服务器都有基本的筛选流程，试图捕捉最糟糕的提交内容，以阻止错误信息的传播。ChemRxiv在网上发布之前，将所有提交的内容发送给策展学者团队进行快速检查。“这是对我们发布的内容是否合适的基本评估。该公司高级产品经理本•穆德拉克(Ben Mudrak)说:“我们的团队会检查每份提交的内容是否符合我们的范围，不包含任何煽动性或潜在危险的内容。ChemRxiv．

ChemRN也有类似的做法，在发布之前，将所有预印本都经过Elsevier期刊编辑的审核。SSRN董事总经理格雷戈里•戈登(Gregory Gordon)说:“有人会迅速检查每一份发出去的预印本，以确保没有什么疯狂的东西遗漏。”

快速的反馈

发布预印本的另一个常见原因是获得早期社区对研究的投入。穆德拉克说:“预印本是获得想法早期反馈的好方法，当我们与作者交谈时，这是他们看到预印本效用的最大方式之一。”

在收到Covid-19检测预印本的反馈后，Saggiomo修改了文本，澄清了一些观点，然后将其提交给传统的同行评审期刊。更新后的文本也可在ChemRxiv．Saggiomo解释说:“当我们在同一个项目上工作几个月或几年的时候，不仅有两名推荐人，还有数百名阅读预印本的人的新鲜眼光，我觉得非常有用。”

印度理工学院孟买分校的物理化学教授Naresh Patwari也从社区对预印本的反馈中受益。2020年10月，他发布了一篇预印本，详细介绍了范德华配合物在光激发后的物理化学研究arXiv．帕特瓦里说:“有很多人，包括该领域的大专家，给我写信，提出意见和建设性的批评。”“我们进行了一些非常好的讨论。他目前正在修改论文，以纳入同行的意见，然后将其提交给期刊。

Saggiomo很兴奋，因为一名研究人员不仅在心理上考虑了他的另一份预印本，还亲自测试了预印本详细列出的程序。贴在ChemRxiv2021年6月，这预印描述了将一台便宜的3D打印机改造成三个(通常非常昂贵)注射泵。不到三周后，美国俄克拉荷马大学的一名研究人员发送了一张她的实验室使用该协议制作的泵的照片。Saggiomo解释说:“我没有给他们任何输入，所以这证明了只要阅读并遵循说明，该协议是可重复的。”从那以后，又有四个小组告诉他，他们成功地复制了这个设计。他补充说:“有一个小组甚至将其用于新的打印机，我们将这种新设计添加到我们的纸张上。”

然而，这两个化学预印本服务器都不允许读者在他们的网站上发表评论。戈登解释说:“我们很早就有关于SSRN的评论，大概在15年前，从100条评论中筛选出一两条有思想的评论是一种噪音，浪费了每个人的时间。”相反，对话通过电子邮件或社交媒体进行。他补充说:“大多数关于预打印研究的有趣讨论都发生在Twitter上。”

然而，一些其他学科的预印本服务器在他们的网站上托管评论。BioRxiv而且MedRxiv也允许同行评议意见而且对应在期刊编辑和作者之间与预印本一起发布。

声称新奇

科学是一个竞争激烈的领域，能够更快地为一个新颖的想法贴上名字是使用预印本的另一个反复出现的原因。Blackmond解释说，期刊评审过程可能需要几个月的时间，预印本从提交到发表通常需要48小时。穆德拉克说，这是一种宣示主张的方式。“如果你有了一些让你非常兴奋的新结果，预印本可以帮助你先把自己的名字发布出去。”

尼尔森解释说，如果你的速度不够快，预印本服务器还可以帮助你分享风头。2018年10月，瑞典的一个小组发表了一份报告纸在杂志中《应用化学》其中的研究内容与他刚刚提交给另一家杂志的手稿相似。这两篇论文都描述了使用电子晶体学作为x射线晶体学的快速替代品来确定小分子的三维结构。“杂志因为另一篇论文而拒绝了我们的论文，我们决定刊登它ChemRxiv所以我们也可以因此获得荣誉，”尼尔森说。他的预印是在《应用化学》论文发表后，他在推特上发表了这篇文章，这些团体分享了赞美来自社区。

尼尔森小组也立即重新提交了他们的论文ACS中央科学它是在哪里审查的发表不到三周。他解释说，当时预印本已经收到了“成千上万的读者”。它目前是有史以来第三大被访问的预印本ChemRxiv到2021年7月底，该网站已被访问近7.9万次。

尼尔森说，在被抢先报道之前，他对预印本的想法并不在意，但现在——只要他的合著者同意——他把他团队的所有论文都放在预印本服务器上。他解释说:“有了预印本，你的想法就会在出版之前被记录下来。”

然而，关于预印本是否真的可以用来建立优先级的讨论仍在进行中。“我的感觉是，一旦一篇论文被发表ChemRxiv是同行评审和在文献中，那么ChemRxiv时间戳应该保持不变，”布莱克蒙德说。但她补充说，并非所有人都这么认为。

开放的谈话

预打印服务器也可以用于进行公开对话。他说，我们(在SSRN上)看到了金融领域一些非常有趣的事情，特别是在这些年来的一些金融危机期间，我们实际上与人们进行了非常深思熟虑的辩论，有些情况下是诺贝尔奖得主，讨论想法，来来回回。一个人发布预印本，另一个人发布不同的观点，”戈登说。他在这些和信在皇家学会成立初期，艾萨克·牛顿和罗伯特·博伊尔等科学家用它来辩论理论。

英国格拉斯哥大学的化学教授Lee Cronin说，化学家应该更多地使用预印本来讨论研究想法。如果你看看物理学arXiv或bioRxiv在美国，人们正在研究的许多新想法可能需要几年的时间才能通过系统(并发表)。我放上去的预印本ChemRxiv是用来开启谈话的。”

布莱克蒙德目前正在使用ChemRxiv与德国柏林自由大学的马赛厄斯·克里斯特曼公开讨论一个复杂的情况。两个小组都在研究烯胺催化机制，2021年3月，Christmann发表了一篇文章预印在ChemRxiv挑战了布莱克蒙德实验室发表的大量研究成果。两个月后，布莱克蒙德发布了一条响应在同一预打印服务器上。布莱克蒙德说:“推特上有人评论说，与同行评议的文献相比，这样一场科学讨论进行得如此之快。”

她的小组的回应包含了新的数据，这是研究的必要条件ChemRxiv．然而，ChemRN欢迎任何有助于科学讨论的东西，Gordon说。例如，它允许详细描述仍处于早期阶段的研究的手稿，以及文献综述。

职业生涯奖金

初入职业生涯的化学家可能会从使用再版服务器中获得最大的收益，许多科学资助机构现在允许在拨款申请中包括预印本。这包括UKRI(英国研究与创新)，欧洲研究委员会和美国国家科学基金会。

我们积极地研究ChemRxiv用于调试引线

梅·科普西，化学科学

事实证明，它们在求职时也很有用。“我真的很喜欢那些早期职业研究人员或讲师的简历上有一两份预印本，你可以阅读，而不是只说‘我有三篇论文要提交自然’，Coudert解释道。“如果有预印本的链接，我就可以去查一下，(自己评估一下作品的质量)。这样做对候选人有帮助。”

尼尔森说，如果工作已经被预先打印好，学生们也更容易知道他们可以在面试时讨论哪些工作。他们可以去参加工作面试，知道谈论这些结果是可以接受的，因为这已经被记录下来了。”

它还可以帮助研究人员确定哪些期刊最适合他们的工作:一些化学期刊最近开始寻找关于预印本的推文，并在预印本服务器上寻找适合他们期刊的文章。尼尔森说:“我们有一半以上的预印本会让副编辑联系我们，问我们是否愿意投稿给他们的杂志。”我们积极地观察ChemRxivRSC杂志的执行编辑May Copsey说化学科学．

未来

在经历了化学预印本的坎坷起步之后，化学家们在过去四年中越来越多地接受了预印本服务器。这次大流行凸显了它们作为一种工具的实用性，可以迅速和公开地传播研究成果，供他人使用，但化学家们也发现了它们的无数其他用途。这些措施包括在向期刊投稿前从社区获得快速反馈以改进论文，在新发现上盖章以及与其他科学家进行公开辩论。

期刊本身应该鼓励作者将论文存档

Naresh Patwari，孟买印度理工学院

尽管如此，预印本在化学界的使用仍远未普及。Coudert之前估计每年大约有50万篇化学和化学相关领域的论文发表在期刊上。相比之下，在他们推出后的四年里ChemRxiv共发布了12092份预印本，ChemRN刚刚超过16000份。

Saggiomo相信它们的应用将会缓慢而稳定地继续下去。他说:“如果我们教育新一代人，让许多同行发表评论比让两个匿名的推荐人发表评论更有用，我认为(学术出版)一两代人就会改变。”然而，帕特瓦里提出了一个加快速度的建议:“期刊本身应该鼓励作者先把论文放在档案馆里，比如说，在他们把论文送到同行评议之前，先保存15天。”

Coudert还预测，随着研究人员越来越多地因为气候变化的原因而避免出差，他们的使用将会增加。他解释说:“在会议上，你谈论最近完成或即将完成的工作，你在咖啡休息时间从人们那里得到反馈。”“预印本的作用与会议沟通是平行的。”

妮娜·诺特曼，英国索尔兹伯里科普作家

本文中的图表于2021年10月11日更新，以澄清ChemRxiv已出版的预印本Angew。化学．