合成化学的方法可以是一个基因和基因组合成的有效和具有成本效益的方法

化学家使用锅点击化学的多个片段的DNA一起加入到一个有功能的基因。可能是一个更加有效和节省成本的方法合成基因和基因组的方法,尤其是那些包含表观遗传修饰。

基因合成是生命科学的一个重要工具,是一个关键的一部分,人类基因组计划的第二代,HGP-write,旨在从头构建基因组。但是合成DNA序列精确和合理的收益率是很困难的。可靠地自动合成只能产生DNA链长约50到100基地。这意味着研究人员必须加入许多这样的DNA片段合成与数以百计的基地,一个基因或一个基因组含有数以千计数以百万计的基地。

基因合成

来源:施普林格自然

Azide-alkyne '点击'创建三唑反应DNA链生成一个完整的基因之间的联系

当前的基因和基因组合成的方法实现这一使用酶PCR(聚合酶链反应)等方法。然而,这些技术可以耗费时间,因为聚合酶不区分修改和未修改的版本的基地,特有的表观遗传修饰,如不能从模板链的甲基化模板链。

2011年,领导的一个团队汤姆布朗,然后是南安普顿大学的,阿里Tavassoli南安普顿大学的,点击使用化学- azide-alkyne反应,创建一个三唑链接加入DNA链和显示,细菌可以表达信息编码在triazole-linked DNA质粒。1现在,研究人员探索细胞是否会容忍长基因,有三唑联系。

他们合成10互补DNA片段各3叠氮化和5炔。片段然后自我组装形成绿色荧光蛋白的遗传指令iLOV。“点击”添加一个铜催化剂碎片在一起。结果是335 -碱基对基因有四个三唑在每个链连接。

这种基因被插入大肠杆菌发出绿色荧光显微镜下的细菌,这表明他们的细胞机制可以读取基因和产生iLOV蛋白质。

基因合成反应图

来源:施普林格自然

一旦互补链组装,添加铜催化剂发起的点击反应链联结在一起

研究小组还利用该方法合成的一个版本iLOV基因甲基胞核嘧啶在四个序列中的特定位置。通过使基因位点专一的表观遗传修饰,工作有潜力在基因组合成和合成生物学,Tavassoli说。单击事件合成不需要酶,所以很容易被自动化,目前可能会减少时间和成本与基因组合成相关,他补充道。

Rajesh Viswanathan凯斯西储大学化学生物学家,是印象深刻,细胞可以合成基因的过程。除了引入表观遗传修饰,他想象的卸货三唑可能更容易将人造基因插入细胞通过减少DNA的磷酸二酯骨干的负电荷通常可以防止它穿过细胞膜。